A história do seu povo relata que chegaram as margens do rio Paranã negros fugitivos das lavouras de cana de açúcar do litoral, sertão baiano e das minas de ouro.
No registro paroquial mostra a fundação de uma Vila por nome de Flores em 1653 pelo bandeirante Manoel Rodrigues Tomar. Nesta época, já se encontravam famílias africanas instaladas ali. O quilombo tinha o nome de Conceição e era composto por negros e indígenas.
Com a chegada da comitiva e fazendeiros que também fugiram de um grande período de seca no sertão baiano formaram o Arraial Vila de Flores em homenagem ao filho do bandeirante Manoel Rodrigues Tomar apelidado de Flores.

Fonte: IBGE